More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1331 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  43.34 
 
 		 908 aa  709    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  43.45 
 
 		 910 aa  712    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  43.34 
 
 		 908 aa  709    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  43.34 
 
 		 908 aa  709    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  43.24 
 
 		 908 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  44.86 
 
 		 904 aa  692    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  46.32 
 
 		 929 aa  714    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  44.49 
 
 		 909 aa  699    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  44.92 
 
 		 905 aa  726    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  43.42 
 
 		 908 aa  701    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  43.24 
 
 		 908 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  44.7 
 
 		 905 aa  726    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  43.34 
 
 		 908 aa  709    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  46.21 
 
 		 896 aa  708    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  43.45 
 
 		 908 aa  711    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  45.58 
 
 		 909 aa  734    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  45.54 
 
 		 904 aa  736    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  56.15 
 
 		 860 aa  796    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  45.36 
 
 		 903 aa  716    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  44.97 
 
 		 904 aa  693    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  45.7 
 
 		 942 aa  718    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  43.21 
 
 		 910 aa  712    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  42.65 
 
 		 899 aa  706    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  43.45 
 
 		 910 aa  712    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  43.36 
 
 		 908 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  42.63 
 
 		 915 aa  687    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  87.16 
 
 		 872 aa  1396    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  44.63 
 
 		 904 aa  685    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  43.13 
 
 		 914 aa  712    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  72.25 
 
 		 871 aa  1190    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  54.87 
 
 		 860 aa  780    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  54.65 
 
 		 860 aa  808    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  42.79 
 
 		 908 aa  696    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 872 aa  1743    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  44.38 
 
 		 920 aa  679    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  43.24 
 
 		 908 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  40.7 
 
 		 909 aa  644    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  43.24 
 
 		 914 aa  714    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  43.53 
 
 		 908 aa  698    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  43.35 
 
 		 914 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  43.45 
 
 		 908 aa  711    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  46.46 
 
 		 902 aa  693    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  46.08 
 
 		 902 aa  725    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  44.92 
 
 		 905 aa  730    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  44.86 
 
 		 904 aa  692    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  43.5 
 
 		 908 aa  707    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  44.7 
 
 		 905 aa  719    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  43.34 
 
 		 908 aa  709    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  43.24 
 
 		 908 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  82.59 
 
 		 877 aa  1390    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  37.03 
 
 		 1010 aa  592  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  36.82 
 
 		 1030 aa  585  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.02 
 
 		 947 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  45.62 
 
 		 1039 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  40.71 
 
 		 677 aa  392  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  39.19 
 
 		 798 aa  389  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  40.06 
 
 		 642 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  39.84 
 
 		 631 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  40.51 
 
 		 818 aa  382  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  42.64 
 
 		 648 aa  311  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  43.28 
 
 		 648 aa  308  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.26 
 
 		 797 aa  267  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  29.81 
 
 		 797 aa  251  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  30.6 
 
 		 782 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.6 
 
 		 782 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  30.58 
 
 		 717 aa  247  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  31.76 
 
 		 795 aa  245  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  30.05 
 
 		 777 aa  245  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  30.63 
 
 		 779 aa  244  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  31.33 
 
 		 791 aa  244  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  29.59 
 
 		 777 aa  243  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  29.8 
 
 		 783 aa  243  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  30.57 
 
 		 714 aa  242  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  29.22 
 
 		 783 aa  239  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.64 
 
 		 771 aa  239  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  28.92 
 
 		 783 aa  238  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  29.04 
 
 		 808 aa  237  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  30.17 
 
 		 776 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  30.17 
 
 		 776 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  29.11 
 
 		 700 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  30.17 
 
 		 776 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  30.17 
 
 		 776 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  30.17 
 
 		 776 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  30.17 
 
 		 776 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  30.44 
 
 		 791 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  29.12 
 
 		 721 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  29.83 
 
 		 790 aa  234  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  29.05 
 
 		 710 aa  234  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  30.02 
 
 		 776 aa  234  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  29.73 
 
 		 776 aa  231  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  28.9 
 
 		 715 aa  230  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  29.53 
 
 		 707 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  29.79 
 
 		 776 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  30.03 
 
 		 797 aa  229  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  29.79 
 
 		 776 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  29.33 
 
 		 809 aa  228  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  29.22 
 
 		 777 aa  228  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  29.38 
 
 		 776 aa  227  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.4 
 
 		 798 aa  227  7e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  29.49 
 
 		 720 aa  227  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>