63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0765 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0765  ferredoxin  100 
 
 		 277 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  60.12 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  55.49 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  54.94 
 
 		 205 aa  206  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  56.25 
 
 		 162 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0629  chlorosome envelope protein X  56.33 
 
 		 198 aa  193  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  44.1 
 
 		 349 aa  146  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  41.98 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  39.33 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  41.61 
 
 		 356 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  41.29 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  39.75 
 
 		 355 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  40.25 
 
 		 360 aa  122  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  36.2 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2149  ferredoxin  37.82 
 
 		 226 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0768  ferredoxin  36.63 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0876  ferredoxin  33.13 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.931688  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  42.11 
 
 		 145 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0763  ferredoxin  38.32 
 
 		 228 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  36.46 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  30.58 
 
 		 821 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  38.36 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  36.19 
 
 		 598 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  37.97 
 
 		 570 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  30.77 
 
 		 160 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  28.03 
 
 		 580 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  31.46 
 
 		 160 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  36.25 
 
 		 160 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  31.46 
 
 		 160 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  36.76 
 
 		 111 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 		 578 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  33.98 
 
 		 592 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  35.37 
 
 		 605 aa  45.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 		 574 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  35.48 
 
 		 357 aa  46.2  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  26.61 
 
 		 119 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  36.51 
 
 		 104 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  33.01 
 
 		 592 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  30.77 
 
 		 618 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  31.96 
 
 		 98 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0827  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.78 
 
 		 112 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0161853  normal  0.598129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0678  ferredoxin, 2Fe-2S  34.78 
 
 		 112 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  32.81 
 
 		 101 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3215  ferredoxin  31.88 
 
 		 110 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0952448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  30.14 
 
 		 101 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.46 
 
 		 973 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  30.14 
 
 		 101 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  33.82 
 
 		 111 aa  42.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  30.28 
 
 		 118 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  33.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  33.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  28.77 
 
 		 101 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  30 
 
 		 119 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  31.17 
 
 		 92 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1365  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.87 
 
 		 127 aa  42.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.82 
 
 		 111 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  30.43 
 
 		 112 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.82 
 
 		 111 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.82 
 
 		 111 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  33.82 
 
 		 111 aa  42.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  34.52 
 
 		 98 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.82 
 
 		 112 aa  42  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  30.88 
 
 		 113 aa  42  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>