21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46015 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_46015  predicted protein  100 
 
 
356 aa  731    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  51.31 
 
 
357 aa  300  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  31.8 
 
 
312 aa  97.8  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  35.11 
 
 
128 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  33.33 
 
 
102 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  35.87 
 
 
132 aa  50.4  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  31.31 
 
 
97 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  31.31 
 
 
97 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.53 
 
 
410 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  35.06 
 
 
98 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  32.47 
 
 
98 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  38.37 
 
 
120 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  32.18 
 
 
120 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  32.18 
 
 
120 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  32.18 
 
 
120 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  38.82 
 
 
125 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  33.33 
 
 
144 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  27 
 
 
259 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.26 
 
 
408 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  30.3 
 
 
98 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  29.76 
 
 
158 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>