52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_03481 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  100 
 
 
120 aa  239  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  80.83 
 
 
120 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  79.17 
 
 
120 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  80 
 
 
120 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  67.23 
 
 
120 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  58.82 
 
 
125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  51.67 
 
 
163 aa  134  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  50.83 
 
 
158 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  46.46 
 
 
98 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  43.43 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  46.39 
 
 
97 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  46.39 
 
 
97 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  44 
 
 
102 aa  92  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  42.42 
 
 
98 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  45.45 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  41.41 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  40.82 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  40.21 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  39.56 
 
 
259 aa  60.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  32.69 
 
 
312 aa  54.3  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  32.58 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  35.37 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  42.86 
 
 
586 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  35.29 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  35.29 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  33.7 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  31.94 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  26.61 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  31.25 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  34.92 
 
 
355 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  27.03 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  29.41 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  40.62 
 
 
355 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  41.27 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  27.36 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  37.88 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  39.29 
 
 
226 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  31.51 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  42 
 
 
357 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  34.72 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  40.35 
 
 
561 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  28.89 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  27.91 
 
 
304 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  36.51 
 
 
218 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  27.27 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  46.81 
 
 
558 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  32.35 
 
 
106 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46015  predicted protein  31.4 
 
 
356 aa  41.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  28.89 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  25 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  35.59 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  48.94 
 
 
580 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>