34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0463 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  100 
 
 
108 aa  225  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  100 
 
 
108 aa  225  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  68.52 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  66.67 
 
 
112 aa  158  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  54.9 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  52.73 
 
 
123 aa  116  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4087  ferredoxin  50.98 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  40.22 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  39.53 
 
 
98 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  37.89 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  37.36 
 
 
97 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  37.36 
 
 
97 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  34.74 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  42.55 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  39 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  36.36 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  38.82 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  35.42 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  37 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  35.05 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  36 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  35.29 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  31.52 
 
 
304 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  33.72 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  33.72 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  33.72 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  33.72 
 
 
598 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  40.74 
 
 
558 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56260  hypothetical protein  36 
 
 
308 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  32.56 
 
 
638 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  45.45 
 
 
612 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  33.33 
 
 
606 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  31.4 
 
 
312 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0654  ferredoxin  30.21 
 
 
124 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>