27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0654 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0654  ferredoxin  100 
 
 		 124 aa  254  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0875  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain- containing protein  57.69 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  39.39 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  37.5 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4087  ferredoxin  40.22 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  38.37 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  36.14 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  36.14 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  35.53 
 
 		 640 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  35.53 
 
 		 640 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  42.11 
 
 		 410 aa  42  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  34.25 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4602  ferredoxin  32.98 
 
 		 106 aa  42  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  30.23 
 
 		 112 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  34.07 
 
 		 102 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  30.95 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  31.33 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  35.53 
 
 		 640 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  41.38 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.63 
 
 		 408 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  36.17 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  34.21 
 
 		 640 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.99 
 
 		 407 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  36.17 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  30.21 
 
 		 561 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  30.21 
 
 		 108 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  30.21 
 
 		 108 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.170361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>