21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0875 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0875  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain- containing protein  100 
 
 		 105 aa  213  5.9999999999999996e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0654  ferredoxin  57.69 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  43.75 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4087  ferredoxin  38.3 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  32.41 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  36.11 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  31.96 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  32.04 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  30.97 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  34.12 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  33.72 
 
 		 112 aa  42  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  28.83 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.85 
 
 		 408 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  33.02 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  34.38 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.53 
 
 		 407 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  30.21 
 
 		 612 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  29.59 
 
 		 605 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.77 
 
 		 407 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  29.33 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  36 
 
 		 110 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>