124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1703 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1703  ferredoxin  100 
 
 
117 aa  235  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  39.51 
 
 
319 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.51 
 
 
342 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  41.56 
 
 
334 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  35.44 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  37.04 
 
 
561 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  38.33 
 
 
322 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.14 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  41.18 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.75 
 
 
112 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.56 
 
 
351 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  41.79 
 
 
137 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  33.78 
 
 
112 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  34.18 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0955  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.88 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.47066  normal  0.0577482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40 
 
 
333 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.88 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0444607 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  33.33 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2966  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.02 
 
 
354 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0998683  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1342  ferredoxin  38.46 
 
 
322 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.605474  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2158  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  35.14 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09840  ferredoxin  37.93 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260552  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2031  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.71 
 
 
688 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.68 
 
 
348 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2574  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.78 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44606  hitchhiker  0.00922015 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1880  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.871974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  34.92 
 
 
318 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  37.65 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  30.67 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.67 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.67 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  34.62 
 
 
341 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1149  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.67 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796638  normal  0.0925301 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.23 
 
 
348 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1703  ferredoxin, 2Fe-2S  32 
 
 
113 aa  43.5  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0360093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2727  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 
113 aa  43.5  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  30.67 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2459  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.43 
 
 
352 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109529  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2212  2Fe-2S ferredoxin  32 
 
 
113 aa  43.5  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3108  2Fe-2S ferredoxin  32 
 
 
113 aa  43.5  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.514759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2594  2Fe-2S ferredoxin  32 
 
 
113 aa  43.5  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2650  2Fe-2S ferredoxin  32 
 
 
113 aa  43.5  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1484  2Fe-2S ferredoxin  32 
 
 
113 aa  43.5  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  50 
 
 
354 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1558  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.43 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0549119  normal  0.219971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.43 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  33.33 
 
 
319 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0320  ferredoxin  32.26 
 
 
348 aa  42.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  37.68 
 
 
606 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3939  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase / oxidoreductase, NAD-dependent  35.09 
 
 
558 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  32.94 
 
 
315 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.24 
 
 
353 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.82 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.88 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2827  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  48.89 
 
 
419 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2147  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.4 
 
 
562 aa  42  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.82 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.82 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2675  ferredoxin  36.76 
 
 
352 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.237463  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.78 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.82 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.76 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1030  ferredoxin, 2Fe-2S type  31.65 
 
 
112 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891184  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.82 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.82 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.82 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.82 
 
 
112 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4333  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  41.18 
 
 
344 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  44 
 
 
343 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  48 
 
 
354 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  48 
 
 
354 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2319  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  56.25 
 
 
330 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0219052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2218  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  56.25 
 
 
324 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129859  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0827  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.38 
 
 
112 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0161853  normal  0.598129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0678  ferredoxin, 2Fe-2S  30.38 
 
 
112 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.215158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  31.08 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.08 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2641  iron-sulfur cluster-binding protein  41.51 
 
 
599 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.18 
 
 
318 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  32.43 
 
 
113 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  31.08 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.43 
 
 
111 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40 
 
 
340 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.08 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.08 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  34.18 
 
 
361 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.08 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.08 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.81 
 
 
687 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.08 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2326  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  56.25 
 
 
324 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0217103 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.08 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0760  ferredoxin, 2Fe-2S  30.95 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  37.1 
 
 
627 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1691  oxidoreductase FAD-binding region  44.44 
 
 
327 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  36.49 
 
 
354 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
338 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  36 
 
 
319 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>