More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4547 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4547  ferredoxin  100 
 
 
99 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  54.35 
 
 
339 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  52.27 
 
 
352 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  52.75 
 
 
351 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5095  ferredoxin  48.35 
 
 
350 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.276207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4710  ferredoxin  48.35 
 
 
350 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4796  ferredoxin  48.35 
 
 
350 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  53.41 
 
 
347 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13604  hemoglobine-related protein hmp  48.35 
 
 
358 aa  104  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.714491  normal  0.806459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  51.14 
 
 
346 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  51.14 
 
 
346 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  45.45 
 
 
358 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5309  ferredoxin  46.15 
 
 
356 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.73 
 
 
345 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.05 
 
 
341 aa  89.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  40.91 
 
 
330 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.59 
 
 
346 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  44.32 
 
 
354 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  39.18 
 
 
361 aa  82  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0320  ferredoxin  46.59 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0543  ferredoxin  43.04 
 
 
339 aa  77.4  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032188 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1980  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  41.57 
 
 
362 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.144649  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2577  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  41.57 
 
 
362 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.616553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0008  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.57 
 
 
362 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0203524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0254  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.71 
 
 
362 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0292434  normal  0.0307686 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3840  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.57 
 
 
362 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0011  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.57 
 
 
362 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3425  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.45 
 
 
362 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0901107  normal  0.882381 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3779  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.57 
 
 
362 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0589683  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3533  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  41.57 
 
 
362 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3115  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  41.57 
 
 
362 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136188  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0245  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.71 
 
 
362 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0291  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  41.57 
 
 
362 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2861  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.33 
 
 
362 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3101  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.57 
 
 
362 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0125326  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0228  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.45 
 
 
362 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0180747  hitchhiker  0.0014836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2780  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.33 
 
 
362 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0478602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3666  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.45 
 
 
362 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100364  hitchhiker  0.000000384073 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0326  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.33 
 
 
362 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0306  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.33 
 
 
362 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.144813  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3447  ferredoxin  40 
 
 
340 aa  73.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  42.68 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2391  ferredoxin  39.39 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162374  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2202  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  44.79 
 
 
363 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0120685  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.7 
 
 
702 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  33.33 
 
 
350 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4257  ferredoxin  39.77 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118014  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.33 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0651  ferredoxin  40.22 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4880  ferredoxin  37.21 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3851  ferredoxin  44.32 
 
 
360 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.5 
 
 
358 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  31 
 
 
357 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1502  ferredoxin  37 
 
 
365 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0377  ferredoxin  35.29 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1439  oxidoreductase FAD-binding subunit  37 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262809  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2143  ferredoxin  34.88 
 
 
344 aa  65.5  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000191342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3949  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.83 
 
 
361 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.46 
 
 
358 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0381  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.59 
 
 
365 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.155408  hitchhiker  0.00902786 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  47.95 
 
 
342 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.29 
 
 
358 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.95 
 
 
362 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3373  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase PaaK subunit  37.35 
 
 
361 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0814  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.36 
 
 
365 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382172  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  38.2 
 
 
670 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.04 
 
 
360 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.08 
 
 
358 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.69 
 
 
358 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.69 
 
 
358 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0991  putative ring-hydroxylation complex protein 4  34.83 
 
 
361 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153237  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0203  hypothetical protein  43.48 
 
 
205 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  36.9 
 
 
356 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  44.93 
 
 
625 aa  62.8  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.08 
 
 
669 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.71 
 
 
358 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3210  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.14 
 
 
362 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4563  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.37 
 
 
364 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.659135 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.9 
 
 
349 aa  62.8  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.69 
 
 
358 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3491  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.37 
 
 
364 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.168778 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0608  ferredoxin reductase protein  33.66 
 
 
363 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  38.3 
 
 
339 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  38.3 
 
 
339 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3822  ferredoxin  42.03 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654022  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3808  ferredoxin  42.03 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641293  normal  0.164751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  38.3 
 
 
339 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3896  ferredoxin  42.03 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699938  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  40.62 
 
 
597 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2886  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase  36.84 
 
 
366 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113682  decreased coverage  0.000127414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.77 
 
 
362 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.13 
 
 
358 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1231  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.51 
 
 
364 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18640  flavodoxin reductase family protein  33.75 
 
 
355 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  39.53 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  42.19 
 
 
627 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0508  ferredoxin  30.59 
 
 
350 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.303507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.29 
 
 
356 aa  59.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2612  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.14 
 
 
362 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4069  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.84 
 
 
369 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>