More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0203 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0203  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  45.86 
 
 
585 aa  177  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  42.33 
 
 
670 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  42.2 
 
 
597 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.94 
 
 
702 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  42.7 
 
 
627 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.39 
 
 
669 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  44.21 
 
 
625 aa  154  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.98 
 
 
688 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.5 
 
 
677 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.17 
 
 
585 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.69 
 
 
366 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  32.8 
 
 
366 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.94 
 
 
374 aa  95.5  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.95 
 
 
356 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  31.72 
 
 
366 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  32.29 
 
 
379 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  30.81 
 
 
368 aa  92.8  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.15 
 
 
363 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.19 
 
 
368 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  33.94 
 
 
616 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  27.84 
 
 
373 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  32.68 
 
 
356 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.2 
 
 
390 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  27.84 
 
 
381 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.69 
 
 
366 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.2 
 
 
366 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.46 
 
 
342 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  33.94 
 
 
662 aa  86.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  31.89 
 
 
605 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  30.11 
 
 
366 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  30.11 
 
 
366 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.9 
 
 
381 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.11 
 
 
367 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  31.71 
 
 
355 aa  85.9  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  31.21 
 
 
365 aa  85.9  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  35.4 
 
 
325 aa  85.9  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2612  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.64 
 
 
362 aa  85.1  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
361 aa  85.1  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  31.29 
 
 
358 aa  85.1  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4710  ferredoxin  36.76 
 
 
350 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4796  ferredoxin  36.76 
 
 
350 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  29.41 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.85 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.32 
 
 
375 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.49 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.9 
 
 
383 aa  84  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.77 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  27.81 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.34 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  31.9 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.34 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  28.07 
 
 
381 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.07 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3822  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.84 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510949  normal  0.275552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  28.34 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  30.32 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.34 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.81 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.07 
 
 
380 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5095  ferredoxin  36.03 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.276207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  33.53 
 
 
596 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.14 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  35.76 
 
 
676 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  30.77 
 
 
365 aa  82  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  35.1 
 
 
358 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  28.19 
 
 
372 aa  81.6  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  27.49 
 
 
381 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  27.49 
 
 
380 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  27.49 
 
 
380 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  27.49 
 
 
380 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  27.13 
 
 
352 aa  81.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.22 
 
 
376 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  28.74 
 
 
394 aa  81.3  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4468  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.12 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.488012  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.71 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  28.4 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  28.18 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13604  hemoglobine-related protein hmp  33.78 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.714491  normal  0.806459 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  30 
 
 
605 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.27 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.8 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1502  ferredoxin  32.28 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  27.57 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.59 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.28 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1748  ferredoxin  30.77 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.764981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.72 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4069  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.27 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.93 
 
 
365 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.93 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  31.03 
 
 
586 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.17 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.3 
 
 
388 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  34.55 
 
 
1148 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.16 
 
 
396 aa  78.6  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.17 
 
 
412 aa  78.2  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0381  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.61 
 
 
365 aa  78.2  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.155408  hitchhiker  0.00902786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.75 
 
 
375 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>