23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3759 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3759  ferredoxin  100 
 
 		 118 aa  249  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3636  ferredoxin  80 
 
 		 100 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1824  putative ferredoxin  83.67 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.213573  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4349  ferredoxin  75.24 
 
 		 111 aa  180  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  32.61 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  35.65 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  35.06 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  33.33 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  40.7 
 
 		 612 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  44 
 
 		 618 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  40.79 
 
 		 547 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  43.86 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  37.29 
 
 		 94 aa  42.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  34.88 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1450  ferredoxin  32.94 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  33.73 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  42.37 
 
 		 355 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  41.94 
 
 		 614 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  29.47 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  35.53 
 
 		 572 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  31.58 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  34.21 
 
 		 592 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  33.96 
 
 		 553 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>