19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1824 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1824  putative ferredoxin  100 
 
 		 123 aa  260  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.213573  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3759  ferredoxin  83.67 
 
 		 118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3636  ferredoxin  72.45 
 
 		 100 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4349  ferredoxin  73.68 
 
 		 111 aa  160  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  32.61 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  42.37 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  34.74 
 
 		 618 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  38.6 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  41.38 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  37.35 
 
 		 612 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  42.11 
 
 		 355 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 586 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36.36 
 
 		 407 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  42.59 
 
 		 355 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  45.1 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  37.93 
 
 		 578 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  36.92 
 
 		 547 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  35.19 
 
 		 407 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  42.62 
 
 		 349 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>