15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4349 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4349  ferredoxin  100 
 
 		 111 aa  233  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3759  ferredoxin  73.64 
 
 		 118 aa  183  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3636  ferredoxin  77.55 
 
 		 100 aa  177  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1824  putative ferredoxin  73.68 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.213573  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  38.96 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  30.43 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  35.9 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  33.77 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  41.67 
 
 		 618 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  39.29 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2143  ferredoxin  29.89 
 
 		 344 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000191342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  41.82 
 
 		 553 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  33.72 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  35.71 
 
 		 612 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3190  hypothetical protein  31.71 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.840017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>