136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0142 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0142  ferredoxin  100 
 
 		 111 aa  225  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1324  ferredoxin  66.32 
 
 		 105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  57.8 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  42.59 
 
 		 109 aa  76.6  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  37.25 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  39 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  33.98 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  35.29 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  36.63 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  30.48 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  45.9 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  45.9 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  36.89 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  43.28 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  42.03 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  44.93 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  46.88 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  48.39 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  45.16 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  45.31 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  38.37 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  44.78 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  44.26 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  31.13 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  44.62 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  41.94 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  43.75 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  43.75 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  31.07 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  38.03 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  43.75 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  43.75 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  35.58 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  43.1 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4602  ferredoxin  32.43 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  43.75 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  42.19 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  38.32 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  29.63 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  37.74 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  31.07 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  40.62 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  39.06 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  42.62 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  34.65 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  41.27 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  32.98 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  39.02 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  35.85 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  41.27 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  34.65 
 
 		 106 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  32.94 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  31.82 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  38.16 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  48.48 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16510  ferredoxin  29.2 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  43.94 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  43.75 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  43.94 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  40.32 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  42.42 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  32.32 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  44.12 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  36.63 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  41.54 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  36.67 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  33.71 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  41.67 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  40.62 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  34.62 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  35.9 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  40.91 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  33.65 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  41.79 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  47.92 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  34.69 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  41.79 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.74 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  36.26 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  37.97 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  35.96 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  39.06 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  43.75 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  39.66 
 
 		 445 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  41.94 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  30.77 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  42.86 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  38.46 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  43.75 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  38.89 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.38 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  43.75 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.38 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  40.38 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  40.38 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>