81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1812 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1812  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.579583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  30.77 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  30.77 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  34.34 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  33.33 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  29.81 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  33.68 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  31.58 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  37.31 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  28.85 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  31.31 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  31.31 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  30.3 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  27.88 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  41.67 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  30.53 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  27.83 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  28.72 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  28.85 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4909  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.33 
 
 		 459 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  37.88 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  26.67 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  34.48 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  27 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  26.67 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  26.67 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  35.37 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  37.88 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  31 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  29.47 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  30.25 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  28.43 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  31 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  27.37 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  29.52 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  34.85 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  23.93 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  28.72 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  34.85 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  34.85 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  28.42 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  29.79 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  36.36 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  29.79 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  26.67 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  28.41 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  24.49 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  32.79 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  36.73 
 
 		 553 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  31.65 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  32.84 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  30.77 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  31.43 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  29.47 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  26.47 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  34.85 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  34.85 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  34.85 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  25.84 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  23.16 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  35.38 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  25.51 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  24 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  25.71 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  31.82 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  34.33 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  25.71 
 
 		 605 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  26.83 
 
 		 107 aa  42  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  28.36 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  23.47 
 
 		 104 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  23.47 
 
 		 110 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  24.47 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  24.51 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  30 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  30.38 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  34.72 
 
 		 657 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  44.68 
 
 		 606 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  34.85 
 
 		 110 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0216  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  35.14 
 
 		 113 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>