52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2357 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  100 
 
 		 238 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  43.81 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  37.55 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  40.27 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  34.96 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  33.91 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  36.36 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  31.98 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  34.22 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  32.13 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  33.03 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32 
 
 		 658 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  31.25 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  31.91 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  30 
 
 		 247 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  31.03 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  29.72 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.9 
 
 		 359 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  32.05 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  32.14 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  28.76 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.47 
 
 		 258 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  29.95 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.47 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.61 
 
 		 359 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  29.02 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  28.81 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.95 
 
 		 359 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  29.02 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  28.31 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  27.98 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  28.63 
 
 		 639 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  27.64 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  27.83 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  25.7 
 
 		 378 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  29.53 
 
 		 519 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  32.16 
 
 		 524 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  28.98 
 
 		 492 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  27.6 
 
 		 497 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  30.81 
 
 		 517 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  23.44 
 
 		 475 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  28.98 
 
 		 492 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.29 
 
 		 517 aa  49.3  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  29.17 
 
 		 510 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  26.95 
 
 		 499 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  25 
 
 		 501 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  21.67 
 
 		 510 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.34 
 
 		 477 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3461  putative membrane/exported protein of unknown function  28.28 
 
 		 484 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0343  ferredoxin  23.18 
 
 		 346 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.799415  normal  0.508758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>