34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4221 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 477 aa  941    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  42.98 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0410  PepSY-associated TM helix domain protein  35.74 
 
 		 481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  35.68 
 
 		 482 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  34.93 
 
 		 482 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0228  PepSY-associated TM helix domain protein  35.49 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3461  putative membrane/exported protein of unknown function  35.02 
 
 		 484 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0860  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 488 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  31.03 
 
 		 475 aa  207  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0832  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 475 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  33.82 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1406  PepSY-associated TM helix domain protein  33.4 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.798402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  35.07 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  32.34 
 
 		 519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  32.05 
 
 		 497 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  32.44 
 
 		 510 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.09 
 
 		 517 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  31.9 
 
 		 517 aa  171  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  32.74 
 
 		 524 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  28.87 
 
 		 510 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  32.1 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  25.67 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  24.73 
 
 		 235 aa  54.3  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  23.29 
 
 		 245 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  25.28 
 
 		 221 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  25.28 
 
 		 221 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  25.28 
 
 		 221 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  27.22 
 
 		 234 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  28.49 
 
 		 244 aa  48.5  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  25.67 
 
 		 257 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.74 
 
 		 258 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  24.34 
 
 		 238 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  24.47 
 
 		 238 aa  43.5  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>