26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0410 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  73.39 
 
 		 482 aa  726    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0410  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 		 481 aa  958    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  71.52 
 
 		 482 aa  708    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0228  PepSY-associated TM helix domain protein  57.26 
 
 		 481 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1406  PepSY-associated TM helix domain protein  50.85 
 
 		 471 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.798402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0832  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  48.41 
 
 		 475 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  40.83 
 
 		 475 aa  328  9e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0860  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.17 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  36.69 
 
 		 519 aa  293  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  38.11 
 
 		 492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  38.97 
 
 		 492 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  34.03 
 
 		 501 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  37.95 
 
 		 524 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.28 
 
 		 477 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  37.4 
 
 		 517 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  38.32 
 
 		 497 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.35 
 
 		 517 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  37.34 
 
 		 510 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  32.45 
 
 		 510 aa  253  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  35.02 
 
 		 499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3461  putative membrane/exported protein of unknown function  36.35 
 
 		 484 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0103  hypothetical protein  41.94 
 
 		 78 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 236 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  25.13 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  22.41 
 
 		 247 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  26.97 
 
 		 257 aa  43.1  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>