48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2460 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  513  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  42.57 
 
 		 259 aa  198  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  39.68 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  41.77 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  44.25 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  40.27 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  35.37 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  37.13 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.64 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  36.54 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  118  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  29 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  32.75 
 
 		 234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  31.76 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  28.63 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  35.71 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.34 
 
 		 658 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  32.86 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  30 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  30.24 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  31.92 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  31.3 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  31.08 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  35.29 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  28.24 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.97 
 
 		 359 aa  99  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.2 
 
 		 359 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  31.67 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  31.4 
 
 		 639 aa  92.8  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  29.03 
 
 		 235 aa  92  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  27.24 
 
 		 375 aa  90.1  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.95 
 
 		 359 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.84 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  30.42 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.06 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.52 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  27.06 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  25.53 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0343  ferredoxin  27.78 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.799415  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0860  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.19 
 
 		 488 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.67 
 
 		 477 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  24.69 
 
 		 482 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  27.13 
 
 		 497 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  25.68 
 
 		 492 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0410  PepSY-associated TM helix domain protein  26.97 
 
 		 481 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  23.97 
 
 		 475 aa  42.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  23.14 
 
 		 519 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  26.36 
 
 		 492 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>