42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2409 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  100 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  43.81 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  37.5 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  31.58 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  29.75 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  30.63 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  35.29 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  28.45 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.7 
 
 		 658 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  28.76 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.56 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  29.56 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.06 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  32.14 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  27.47 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.24 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  28.57 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  26.48 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.42 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  27.45 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  23.55 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.42 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  26.59 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  26.13 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  27.27 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  28.26 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  28.26 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  26.64 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  25.42 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.42 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  26.34 
 
 		 639 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  24.1 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  24.62 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  28.26 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0343  ferredoxin  25.32 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.799415  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  23.67 
 
 		 375 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  27.84 
 
 		 501 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  25 
 
 		 510 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.49 
 
 		 477 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  23.42 
 
 		 475 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  22.96 
 
 		 378 aa  42.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>