44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3634 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 260 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  96.15 
 
 		 258 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  95 
 
 		 258 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  94.62 
 
 		 258 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  42.37 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  37.31 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.08 
 
 		 658 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  37.44 
 
 		 639 aa  162  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 359 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.93 
 
 		 359 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  29.96 
 
 		 235 aa  99  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  29.83 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 359 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  28.33 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  30.47 
 
 		 234 aa  92  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  28.63 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  29.15 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  29.03 
 
 		 375 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  26.52 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  26.59 
 
 		 378 aa  86.3  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  28.38 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.91 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  29.91 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  24.02 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  26.69 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  27.19 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  27.62 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  28.77 
 
 		 247 aa  72  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  25.11 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  25.64 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  27.51 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0343  ferredoxin  28.19 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.799415  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  27.96 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  22.89 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  24.07 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  22.87 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  22.87 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  22.34 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  23.2 
 
 		 499 aa  48.9  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  22.04 
 
 		 492 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.47 
 
 		 477 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  23.23 
 
 		 492 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  22.82 
 
 		 482 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>