29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0536 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  964    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  93.97 
 
 		 492 aa  872    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  51.43 
 
 		 497 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  48.67 
 
 		 510 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  49.01 
 
 		 524 aa  411  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  48.7 
 
 		 517 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  47.8 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  45.31 
 
 		 519 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  42.01 
 
 		 499 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  40.78 
 
 		 482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  39.55 
 
 		 482 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0410  PepSY-associated TM helix domain protein  38.49 
 
 		 481 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  37.76 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0228  PepSY-associated TM helix domain protein  39.48 
 
 		 481 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0832  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.14 
 
 		 475 aa  232  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1406  PepSY-associated TM helix domain protein  38.45 
 
 		 471 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.798402  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  31.99 
 
 		 501 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  30.42 
 
 		 510 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0860  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.44 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.2 
 
 		 477 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3461  putative membrane/exported protein of unknown function  34.31 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3708  hypothetical protein  25.81 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2411  hypothetical protein  70 
 
 		 70 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  28.98 
 
 		 238 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0103  hypothetical protein  40.74 
 
 		 78 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  21.61 
 
 		 241 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  25.58 
 
 		 221 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  25.58 
 
 		 221 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  21.98 
 
 		 251 aa  43.1  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>