28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0832 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0832  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 475 aa  894    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1406  PepSY-associated TM helix domain protein  75 
 
 		 471 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.798402  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  51.04 
 
 		 482 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  50.84 
 
 		 482 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0228  PepSY-associated TM helix domain protein  50.84 
 
 		 481 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0410  PepSY-associated TM helix domain protein  48.63 
 
 		 481 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0860  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  53.39 
 
 		 488 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  35.36 
 
 		 475 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  38.97 
 
 		 492 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  40.56 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.12 
 
 		 517 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  40.32 
 
 		 517 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  36 
 
 		 519 aa  236  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  39.18 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  38.48 
 
 		 510 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  33.87 
 
 		 501 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  37.13 
 
 		 524 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.91 
 
 		 477 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3461  putative membrane/exported protein of unknown function  38.02 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  29.12 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  34.55 
 
 		 499 aa  182  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  25.11 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.21 
 
 		 236 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0103  hypothetical protein  40.32 
 
 		 78 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  25.41 
 
 		 246 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  23.95 
 
 		 247 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  27.51 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  25.43 
 
 		 252 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>