35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3331 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  987    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  52.07 
 
 		 492 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  52.78 
 
 		 492 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  45.76 
 
 		 519 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  47.25 
 
 		 510 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  47.34 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  47.34 
 
 		 517 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  45.65 
 
 		 524 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  42.51 
 
 		 499 aa  320  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  38.83 
 
 		 482 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0410  PepSY-associated TM helix domain protein  38.79 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  37.17 
 
 		 475 aa  274  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  36.62 
 
 		 482 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0832  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.16 
 
 		 475 aa  243  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0228  PepSY-associated TM helix domain protein  40 
 
 		 481 aa  240  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1406  PepSY-associated TM helix domain protein  37.42 
 
 		 471 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.798402  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  29.88 
 
 		 510 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0860  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.75 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  31.78 
 
 		 501 aa  213  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.05 
 
 		 477 aa  182  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3461  putative membrane/exported protein of unknown function  32.74 
 
 		 484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2411  hypothetical protein  90.57 
 
 		 70 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.56 
 
 		 359 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  29.91 
 
 		 238 aa  54.3  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.11 
 
 		 359 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0103  hypothetical protein  42.86 
 
 		 78 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.43 
 
 		 359 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  23.01 
 
 		 234 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  32.58 
 
 		 241 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  26.52 
 
 		 247 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  31.46 
 
 		 221 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  32.58 
 
 		 221 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3708  hypothetical protein  29.13 
 
 		 476 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  27.13 
 
 		 257 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  33.33 
 
 		 378 aa  43.5  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>