13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3708 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3708  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  941    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  26.58 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  25 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  26.92 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  25.93 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  24.46 
 
 		 499 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  24.73 
 
 		 235 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  24.29 
 
 		 482 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  24.08 
 
 		 519 aa  50.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  30.38 
 
 		 238 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  25.37 
 
 		 497 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 517 aa  44.3  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  30.48 
 
 		 517 aa  44.3  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>