42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11713 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  490  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  42.34 
 
 		 259 aa  220  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  41.6 
 
 		 259 aa  218  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  39.68 
 
 		 257 aa  194  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  31.67 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  31.9 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  35.45 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.75 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  29.91 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  30.26 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  29.17 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  31.44 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  33.17 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  32.11 
 
 		 247 aa  101  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  28.45 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  29.46 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  27.93 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  28.26 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  31.78 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  28.31 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  29.03 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  27.19 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  26.15 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  27.57 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  27.98 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.77 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.88 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  24.77 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.51 
 
 		 658 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  24.77 
 
 		 639 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.73 
 
 		 477 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3708  hypothetical protein  24.73 
 
 		 476 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.58 
 
 		 359 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  23.58 
 
 		 499 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.62 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.79 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  24.35 
 
 		 482 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  22.71 
 
 		 510 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0343  ferredoxin  21.52 
 
 		 346 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.799415  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0228  PepSY-associated TM helix domain protein  22.8 
 
 		 481 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>