45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3510 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  100 
 
 		 241 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  96.83 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  95.48 
 
 		 221 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  96.38 
 
 		 221 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  35.74 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  36.99 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  36.24 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  40.91 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.37 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  36.07 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  36.52 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  35.16 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  35.65 
 
 		 235 aa  138  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  35.56 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  37.44 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  31.76 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  32.03 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  30.88 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  28.76 
 
 		 238 aa  95.5  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  27.93 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  28.51 
 
 		 245 aa  91.7  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  27.27 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  28.57 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  25.44 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  28.52 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.04 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  25.83 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.09 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.81 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.4 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  24.76 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.89 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  27.31 
 
 		 639 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.67 
 
 		 477 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.56 
 
 		 359 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  24.46 
 
 		 501 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  29.12 
 
 		 510 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.36 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  23.46 
 
 		 375 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  32.58 
 
 		 497 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  23.17 
 
 		 519 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  23.97 
 
 		 524 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  26.92 
 
 		 482 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  25.1 
 
 		 492 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  22.08 
 
 		 378 aa  41.6  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>