38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0735 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  524  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  54.17 
 
 		 639 aa  241  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  50.21 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  49.8 
 
 		 658 aa  238  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  38.68 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.68 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.27 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.29 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  28.24 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  29 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  28.81 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.19 
 
 		 359 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  30.08 
 
 		 375 aa  85.9  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.55 
 
 		 359 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.11 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  31.66 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  29.18 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  27.47 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  27.04 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  27.84 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  28.52 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  26.94 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  28.14 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  26 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.69 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0343  ferredoxin  28.57 
 
 		 346 aa  72  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.799415  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  27.12 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  30.1 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  24.67 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  25.75 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  28.69 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  28.15 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  27.18 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  24.59 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  26.47 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  28.27 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  26.56 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>