54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0375 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  734    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  88.58 
 
 		 359 aa  620  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  85.11 
 
 		 359 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  42.29 
 
 		 375 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  37.47 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0343  ferredoxin  37.61 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.799415  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.35 
 
 		 658 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  30.47 
 
 		 639 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  31.2 
 
 		 257 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  34.09 
 
 		 258 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35 
 
 		 260 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  29.61 
 
 		 238 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  28.16 
 
 		 241 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.64 
 
 		 258 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  28.19 
 
 		 256 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.53 
 
 		 258 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  26.75 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  25.42 
 
 		 244 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  31.51 
 
 		 246 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  24.57 
 
 		 234 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  26.03 
 
 		 247 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  24.59 
 
 		 245 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.75 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  29.69 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  28.19 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  27.73 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  29.09 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  26.79 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  24.78 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  27.2 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  25.76 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  27.23 
 
 		 221 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  23.86 
 
 		 247 aa  53.9  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  46.15 
 
 		 499 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  27.49 
 
 		 235 aa  53.1  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  26.76 
 
 		 221 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  38.57 
 
 		 611 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  25.56 
 
 		 497 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  25 
 
 		 519 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0692  hypothetical protein  32.76 
 
 		 517 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  24.66 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  40.91 
 
 		 534 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  44.68 
 
 		 554 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  35.53 
 
 		 616 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  40.43 
 
 		 514 aa  46.2  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  40.38 
 
 		 592 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  24.79 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  44.19 
 
 		 606 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  38.46 
 
 		 592 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  40 
 
 		 612 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  32.22 
 
 		 558 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.74 
 
 		 431 aa  43.9  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  43.18 
 
 		 685 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  38.46 
 
 		 592 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>