37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6817 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  535  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  85.02 
 
 		 259 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  41.6 
 
 		 235 aa  218  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  41.77 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  29.6 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  35.44 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  30.83 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  35.27 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  31.76 
 
 		 246 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  29.36 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  31.91 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  28.57 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  28.97 
 
 		 252 aa  102  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  32.62 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  29.52 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  27.35 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  25.56 
 
 		 245 aa  85.5  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.63 
 
 		 658 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  27.27 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  27.98 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  25.51 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  27.52 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  28.44 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  27 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  26.59 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  27.12 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.24 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  23.61 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.5 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  29.57 
 
 		 639 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.27 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.15 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.97 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  25.64 
 
 		 375 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  24.4 
 
 		 510 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>