41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2410 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  52.68 
 
 		 234 aa  238  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  44.1 
 
 		 238 aa  158  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  35.68 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.39 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  36.65 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  37.55 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  34.8 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  41 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  36.99 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  35.86 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  31.36 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  35.32 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  35.56 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  36.32 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  36.32 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  32.73 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  31.2 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  35.38 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  32.75 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  30.83 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  30.33 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  31.58 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  29.91 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  25.64 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.23 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  27.84 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.43 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.57 
 
 		 359 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.67 
 
 		 359 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  25.47 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.29 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.47 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.05 
 
 		 658 aa  72  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  22.51 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  26.32 
 
 		 639 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  25.32 
 
 		 510 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  23.29 
 
 		 378 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.55 
 
 		 477 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0343  ferredoxin  24.44 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.799415  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  26.7 
 
 		 499 aa  41.6  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>