39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0271 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  56.28 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  52.8 
 
 		 246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  49.57 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  42.65 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  35.74 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  35.4 
 
 		 221 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  34.96 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  37.31 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  34.38 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  35.4 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  36.91 
 
 		 234 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  31.36 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  136  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  31.91 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  29 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  27.13 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  29.44 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  28.97 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  31.03 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  29.46 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  28.46 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.93 
 
 		 658 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  26.56 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.57 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  24.1 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  27.18 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.21 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  26.46 
 
 		 639 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.21 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.4 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.24 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  24.59 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.21 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  22.22 
 
 		 510 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  19.44 
 
 		 501 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  25.29 
 
 		 378 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  24.07 
 
 		 375 aa  45.4  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>