45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3511 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 258 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  97.29 
 
 		 258 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  95.35 
 
 		 258 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  96.72 
 
 		 260 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  41.95 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.49 
 
 		 658 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  38.27 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  37.89 
 
 		 639 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.06 
 
 		 359 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.06 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  29.96 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.9 
 
 		 359 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  28.57 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  30.4 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  29.52 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  28.82 
 
 		 251 aa  89  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  27.04 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  27.6 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  26.2 
 
 		 245 aa  85.5  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  27.82 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.37 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  26.42 
 
 		 378 aa  82  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  29.29 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  25.42 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  27.97 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  27.31 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  24.45 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  28.77 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  25.43 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  27.36 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  26.05 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  27.51 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0343  ferredoxin  28.7 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.799415  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  28.44 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  22.81 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  22.79 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  22.45 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  23.65 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  22.33 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  22.67 
 
 		 492 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  22.83 
 
 		 492 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  22.31 
 
 		 499 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  25.52 
 
 		 524 aa  45.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.61 
 
 		 477 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  22.82 
 
 		 482 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>