59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3754 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  737    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  88.58 
 
 		 359 aa  621  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  89.11 
 
 		 359 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  42.09 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  37.68 
 
 		 378 aa  212  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0343  ferredoxin  37.5 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.799415  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  32.14 
 
 		 639 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.82 
 
 		 658 aa  99.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  31.97 
 
 		 257 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  30.9 
 
 		 238 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  28.88 
 
 		 241 aa  94  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.06 
 
 		 258 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 258 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.02 
 
 		 260 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  32.18 
 
 		 258 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  26.11 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  26.91 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  25.43 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  29.25 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  25.42 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.66 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  24.89 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  24.77 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  25.76 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  25.55 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  27.38 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  29.24 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  22.22 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  26.5 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  24.56 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  26.43 
 
 		 234 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  44.64 
 
 		 499 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  25.38 
 
 		 247 aa  53.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  43.1 
 
 		 616 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  26.58 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  42.86 
 
 		 611 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0692  hypothetical protein  28.05 
 
 		 517 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  27.49 
 
 		 235 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  35.82 
 
 		 612 aa  49.3  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  23.29 
 
 		 221 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  23.29 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  38.64 
 
 		 534 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  40.43 
 
 		 514 aa  47  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  24.55 
 
 		 519 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  25.11 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  42.86 
 
 		 554 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  25.69 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  40.38 
 
 		 592 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  44.68 
 
 		 640 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  43.18 
 
 		 685 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  38.46 
 
 		 592 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  44.68 
 
 		 640 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  42.55 
 
 		 640 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  30.43 
 
 		 538 aa  43.1  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  35.82 
 
 		 575 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 		 558 aa  43.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  24.77 
 
 		 221 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  32.61 
 
 		 575 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.82 
 
 		 575 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>