38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3753 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  85.9 
 
 		 234 aa  427  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  83.62 
 
 		 235 aa  410  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  47.75 
 
 		 247 aa  194  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.78 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  38.46 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  35.68 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  34.89 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  36.52 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  38.18 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  36.5 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  35.71 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  34.84 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  35.71 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  33.91 
 
 		 238 aa  121  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  33.79 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  28.63 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  30.43 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  28.97 
 
 		 259 aa  99  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  28.26 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  27.35 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.66 
 
 		 258 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.86 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.95 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  29.72 
 
 		 258 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.91 
 
 		 658 aa  79  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  26.67 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  28.14 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  26.87 
 
 		 639 aa  72  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  25.42 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  24.68 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.73 
 
 		 359 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.76 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  25 
 
 		 375 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  23.87 
 
 		 519 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  21.61 
 
 		 499 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>