25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0228 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0228  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 		 481 aa  954    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0410  PepSY-associated TM helix domain protein  57.26 
 
 		 481 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  55.49 
 
 		 482 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  54.15 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1406  PepSY-associated TM helix domain protein  52.97 
 
 		 471 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.798402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0832  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  50.96 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0860  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  49.69 
 
 		 488 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  37.45 
 
 		 475 aa  273  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  39.36 
 
 		 517 aa  269  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  36.44 
 
 		 519 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  40.04 
 
 		 492 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.92 
 
 		 517 aa  266  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  39.43 
 
 		 492 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  39.51 
 
 		 510 aa  262  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  39.76 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  31.16 
 
 		 510 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  40 
 
 		 497 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  33.12 
 
 		 501 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.94 
 
 		 477 aa  233  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  34.43 
 
 		 499 aa  197  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3461  putative membrane/exported protein of unknown function  36.76 
 
 		 484 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.87 
 
 		 236 aa  51.2  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  22.46 
 
 		 251 aa  50.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0103  hypothetical protein  32.86 
 
 		 78 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  22.63 
 
 		 247 aa  44.3  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>