21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0103 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0103  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  54.29 
 
 		 510 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  46.88 
 
 		 524 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  49.09 
 
 		 510 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.12 
 
 		 517 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  44.12 
 
 		 517 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1406  PepSY-associated TM helix domain protein  42.11 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.798402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0832  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 475 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0410  PepSY-associated TM helix domain protein  41.94 
 
 		 481 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  40.32 
 
 		 482 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  40 
 
 		 482 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  42.59 
 
 		 492 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  33.33 
 
 		 519 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  42.86 
 
 		 497 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  29.58 
 
 		 501 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  40.74 
 
 		 492 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0860  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.54 
 
 		 488 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0228  PepSY-associated TM helix domain protein  32.86 
 
 		 481 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3461  putative membrane/exported protein of unknown function  33.33 
 
 		 484 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  42.86 
 
 		 499 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  40 
 
 		 475 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>