30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1525 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 		 517 aa  1013    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  98.65 
 
 		 517 aa  999    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  64.41 
 
 		 524 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  60.81 
 
 		 510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  47.58 
 
 		 492 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  48.89 
 
 		 492 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  47.34 
 
 		 497 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  42.97 
 
 		 519 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  40.79 
 
 		 499 aa  299  9e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  38.77 
 
 		 482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0410  PepSY-associated TM helix domain protein  38.14 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  38.34 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0228  PepSY-associated TM helix domain protein  39 
 
 		 481 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  35.16 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1406  PepSY-associated TM helix domain protein  40 
 
 		 471 aa  236  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.798402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0832  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.12 
 
 		 475 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0860  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.57 
 
 		 488 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  33.14 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  30.25 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3461  putative membrane/exported protein of unknown function  35.31 
 
 		 484 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.7 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0103  hypothetical protein  44.12 
 
 		 78 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  33.51 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2411  hypothetical protein  52.63 
 
 		 70 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.73 
 
 		 236 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  47.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  26.9 
 
 		 258 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  22.62 
 
 		 241 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3708  hypothetical protein  25.36 
 
 		 476 aa  45.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.89 
 
 		 258 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>