28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3656 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1012    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  60.51 
 
 		 524 aa  575  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  60.96 
 
 		 517 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  61.16 
 
 		 517 aa  569  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  48.67 
 
 		 492 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  50 
 
 		 492 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  47.69 
 
 		 497 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  44.83 
 
 		 519 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  41.14 
 
 		 482 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  40 
 
 		 482 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  40.88 
 
 		 499 aa  283  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0410  PepSY-associated TM helix domain protein  37.7 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0228  PepSY-associated TM helix domain protein  39.92 
 
 		 481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  37.45 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  34.39 
 
 		 501 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0832  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.48 
 
 		 475 aa  236  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1406  PepSY-associated TM helix domain protein  37.8 
 
 		 471 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.798402  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0860  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.77 
 
 		 488 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  29.82 
 
 		 510 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3461  putative membrane/exported protein of unknown function  36.36 
 
 		 484 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.4 
 
 		 477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0103  hypothetical protein  44.74 
 
 		 78 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3708  hypothetical protein  27.95 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  29.38 
 
 		 238 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  26.74 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2411  hypothetical protein  47.46 
 
 		 70 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  23.21 
 
 		 251 aa  43.9  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  30.53 
 
 		 378 aa  43.5  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>