More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3101 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3101  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0566  ABC transporter related  65.27 
 
 		 241 aa  321  8e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.328556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1162  ABC transporter related  63.6 
 
 		 241 aa  319  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.596535 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0518  ABC transporter related  59.83 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0593095  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2118  ABC transporter related  60.67 
 
 		 240 aa  298  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  54.39 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  55.23 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  54.39 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  55.23 
 
 		 236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  54.81 
 
 		 234 aa  258  8e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  51.46 
 
 		 233 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  52.72 
 
 		 238 aa  254  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  53.69 
 
 		 259 aa  254  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  51.05 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  54.81 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  52.72 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  54.36 
 
 		 239 aa  251  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  52.3 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  53.56 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 		 234 aa  248  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.3 
 
 		 234 aa  248  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  53.56 
 
 		 239 aa  248  9e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  48.12 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  51.67 
 
 		 236 aa  247  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  48.12 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.54 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.54 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.54 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  53.97 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.54 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  48.12 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.54 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  47.5 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  47.7 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.5 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  47.7 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  47.7 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  52.5 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  52.5 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  52.3 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  52.72 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  51.46 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.28 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  47.28 
 
 		 238 aa  241  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  48.54 
 
 		 238 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  49.79 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  51.46 
 
 		 238 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.12 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  52.5 
 
 		 237 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  46.69 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  53.14 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  51.05 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  50.83 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  50.62 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  49.79 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  50 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  51.67 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  46.86 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  46.86 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 		 234 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  49.37 
 
 		 237 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.37 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  51.05 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  49.79 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  50.21 
 
 		 237 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  49.79 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.87 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  51.88 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  51.46 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  50.21 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  50.83 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  45.87 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  52.5 
 
 		 258 aa  234  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  48.13 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  48.13 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  51.05 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  48.58 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  51.67 
 
 		 234 aa  232  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  50.83 
 
 		 258 aa  232  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  51.88 
 
 		 235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  48.54 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  47.7 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 247 aa  231  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  48.12 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  48.95 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  48.12 
 
 		 237 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.35 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  47.72 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  49.79 
 
 		 265 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  52.72 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  46.03 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>