More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0633 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0633  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 340 aa  692    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0396  sensor histidine kinase  55.94 
 
 		 328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.12016  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0884  sensor histidine kinase  51.34 
 
 		 339 aa  334  2e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0814  sensor histidine kinase  51.34 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.183592  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0501  sensor histidine kinase  51.69 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1218  sensor histidine kinase  51.04 
 
 		 339 aa  332  5e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1239  sensor histidine kinase  51.08 
 
 		 333 aa  315  8e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0595  two-component sensor histidine kinase  50.3 
 
 		 338 aa  305  8.000000000000001e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000538509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0914  histidine kinase  48.57 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0668373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2898  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230241  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1727  hypothetical protein  30.25 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1727  hypothetical protein  30.25 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 478 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.42 
 
 		 491 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  29.33 
 
 		 614 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 661 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  31.13 
 
 		 458 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1207  histidine kinase  30.04 
 
 		 577 aa  97.1  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  32.24 
 
 		 481 aa  96.3  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2311  histidine kinase  26.55 
 
 		 347 aa  95.9  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  30.66 
 
 		 465 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  30.66 
 
 		 458 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 662 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  30.66 
 
 		 458 aa  95.1  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  30.66 
 
 		 458 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  30.66 
 
 		 458 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 618 aa  95.1  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1247  histidine kinase  28.64 
 
 		 546 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 659 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.5 
 
 		 598 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2628  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 375 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2532  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 375 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 680 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  28.12 
 
 		 611 aa  93.6  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 674 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0372  histidine kinase  28.51 
 
 		 505 aa  93.6  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  30.84 
 
 		 661 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 691 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  31.1 
 
 		 465 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 581 aa  92.8  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 516 aa  92.4  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 552 aa  92.4  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  28.86 
 
 		 611 aa  92.4  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  31.1 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1445  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1327  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  30.19 
 
 		 458 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  31.1 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2440  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.627522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 832 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  29.72 
 
 		 458 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 600 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  29.33 
 
 		 420 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 559 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0656  histidine kinase  31.11 
 
 		 417 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.572092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4002  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 765 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  30.62 
 
 		 465 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0774  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 766 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 467 aa  90.5  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 552 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 540 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  23.64 
 
 		 621 aa  90.1  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  30.14 
 
 		 465 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 552 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 814 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  31.9 
 
 		 614 aa  90.1  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 586 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 689 aa  89.7  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0114  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 498 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 560 aa  89.4  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0125  histidine kinase  25.45 
 
 		 498 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2997  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 490 aa  89.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  31.03 
 
 		 673 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 484 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  32.06 
 
 		 647 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  25.76 
 
 		 830 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 497 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 581 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0799101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 497 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 829 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 		 773 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 480 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  25.56 
 
 		 829 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 779 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 461 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 498 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 466 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 412 aa  87  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 466 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 736 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 753 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  26.78 
 
 		 774 aa  86.3  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 526 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 492 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 755 aa  85.9  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  26.78 
 
 		 774 aa  85.9  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1499  flagellar regulatory protein B  25.21 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 		 525 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>