More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1239 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1239  sensor histidine kinase  100 
 
 		 333 aa  670    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0501  sensor histidine kinase  59.33 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0396  sensor histidine kinase  56.7 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.12016  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0884  sensor histidine kinase  52.44 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0814  sensor histidine kinase  52.44 
 
 		 339 aa  332  8e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.183592  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1218  sensor histidine kinase  52.13 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0633  ATP-binding region ATPase domain protein  51.08 
 
 		 340 aa  315  8e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0595  two-component sensor histidine kinase  50.15 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000538509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0914  histidine kinase  47.17 
 
 		 327 aa  275  6e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0668373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2898  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230241  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  34.82 
 
 		 465 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  34.82 
 
 		 465 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  34.82 
 
 		 465 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  34.82 
 
 		 465 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  34.38 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0372  histidine kinase  30.84 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0656  histidine kinase  31.22 
 
 		 417 aa  99  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.572092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0774  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  32.46 
 
 		 458 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  32.89 
 
 		 458 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  28 
 
 		 608 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.42 
 
 		 608 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  28 
 
 		 608 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  28 
 
 		 608 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  28.42 
 
 		 608 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  32.46 
 
 		 465 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  32.46 
 
 		 458 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  32.46 
 
 		 458 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0420  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 458 aa  95.9  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00956949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  28 
 
 		 608 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  30.53 
 
 		 674 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  32.46 
 
 		 458 aa  95.5  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1727  hypothetical protein  27.16 
 
 		 343 aa  93.2  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1727  hypothetical protein  27.16 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  31.58 
 
 		 458 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  31.14 
 
 		 458 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0189  histidine kinase  29.86 
 
 		 598 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.602586 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1445  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.49 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  24.65 
 
 		 830 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1440  histidine kinase  30.57 
 
 		 427 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.13 
 
 		 491 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 497 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1207  histidine kinase  28.31 
 
 		 577 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 618 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.67 
 
 		 362 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 412 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1247  histidine kinase  28.37 
 
 		 546 aa  90.1  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1518  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.19 
 
 		 391 aa  89.7  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0435216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.04 
 
 		 598 aa  89.7  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  25.48 
 
 		 363 aa  89.7  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  28.63 
 
 		 573 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02892  putative sensory box sensor histidine kinase in two-component regulatory system  25.44 
 
 		 380 aa  89.4  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 671 aa  89  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 903 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  27.27 
 
 		 829 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.56 
 
 		 546 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 457 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 525 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4400  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.87 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  30.04 
 
 		 673 aa  87  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 422 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.7 
 
 		 457 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  29.78 
 
 		 661 aa  86.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 671 aa  86.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  28.12 
 
 		 412 aa  86.3  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 742 aa  86.3  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  27.75 
 
 		 487 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  28.19 
 
 		 499 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0249  histidine kinase  29.86 
 
 		 459 aa  85.9  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 525 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0460  histidine kinase  30.28 
 
 		 600 aa  85.9  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000673578 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2033  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.41 
 
 		 381 aa  85.9  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.825681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  28.38 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2819  PAS sensor protein  29.52 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.295885  normal  0.569504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3046  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.52 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 600 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2937  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.52 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0320992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 661 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 662 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 631 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 560 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 829 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00545163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  27.48 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 655 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 577 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 492 aa  82.8  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  29.83 
 
 		 577 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 581 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 475 aa  82.8  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 672 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  29.46 
 
 		 613 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 523 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>