More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1440 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1440  histidine kinase  100 
 
 		 427 aa  860    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0189  histidine kinase  42.04 
 
 		 598 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.602586 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1247  histidine kinase  43.3 
 
 		 546 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0656  histidine kinase  39.15 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.572092 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0460  histidine kinase  43.66 
 
 		 600 aa  177  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000673578 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0372  histidine kinase  41.9 
 
 		 505 aa  171  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 618 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0249  histidine kinase  39.56 
 
 		 459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1207  histidine kinase  37.73 
 
 		 577 aa  155  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  30.68 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  23.34 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.47 
 
 		 490 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 671 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.28 
 
 		 546 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  24.08 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.69 
 
 		 747 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.69 
 
 		 747 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.49 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  29.09 
 
 		 501 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  29.02 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.83 
 
 		 752 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.69 
 
 		 747 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 1519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 662 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 661 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3099  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 591 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.564011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 867 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.22 
 
 		 598 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 630 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  31.31 
 
 		 673 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31 
 
 		 608 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  26.94 
 
 		 458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 654 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  31 
 
 		 608 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  31 
 
 		 608 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  30.37 
 
 		 674 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  32.19 
 
 		 608 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  31 
 
 		 608 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  31 
 
 		 608 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 581 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 720 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  28.09 
 
 		 581 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  32.41 
 
 		 611 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 755 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  27.71 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 582 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 526 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 557 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  27.58 
 
 		 458 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  27.58 
 
 		 458 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 525 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  29.18 
 
 		 661 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  27.58 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  29.7 
 
 		 313 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.09 
 
 		 679 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  27.3 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 515 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  27.3 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 672 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  28.7 
 
 		 621 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2985  histidine kinase  23.44 
 
 		 498 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 367 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2325  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 372 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.288819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 543 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  32.42 
 
 		 465 aa  106  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 595 aa  106  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2137  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 377 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2075  sensor histidine kinase (sporulation kinase A)  28.57 
 
 		 377 aa  106  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2071  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 377 aa  106  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.939444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2291  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 377 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2316  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 377 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0078  histidine kinase  28.64 
 
 		 475 aa  106  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1882  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 652 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0696304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.28 
 
 		 539 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  29.74 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 		 642 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.63 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1680  histidine kinase  28.73 
 
 		 381 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0132697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.68 
 
 		 538 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2400  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 372 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 522 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 575 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  29.33 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  27.85 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  29.71 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  29.36 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 604 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529725 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 903 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2440  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.627522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>