More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0460 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0460  histidine kinase  100 
 
 		 600 aa  1193    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000673578 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0189  histidine kinase  45.91 
 
 		 598 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.602586 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0656  histidine kinase  45.07 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.572092 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1207  histidine kinase  36.72 
 
 		 577 aa  183  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1440  histidine kinase  43.66 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0372  histidine kinase  42.01 
 
 		 505 aa  177  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0249  histidine kinase  35.58 
 
 		 459 aa  163  8.000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1247  histidine kinase  38.18 
 
 		 546 aa  158  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 618 aa  155  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 655 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 516 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 490 aa  130  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0625173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  31.1 
 
 		 517 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 502 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  27.62 
 
 		 502 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  27.65 
 
 		 501 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.97 
 
 		 457 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 510 aa  125  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 491 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  28.8 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 655 aa  122  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0301  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 562 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 516 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0604  histidine kinase  28.73 
 
 		 516 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  28.31 
 
 		 655 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 390 aa  120  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.2 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 488 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0323  histidine kinase  29.18 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.449634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  25.89 
 
 		 499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  26.96 
 
 		 490 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.04 
 
 		 461 aa  118  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 492 aa  117  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.7 
 
 		 461 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.7 
 
 		 461 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 929 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2586  sensor histidine kinase  32.03 
 
 		 623 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.209829  normal  0.69032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1131 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  26 
 
 		 465 aa  114  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  29.17 
 
 		 1230 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 867 aa  114  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.63 
 
 		 598 aa  114  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 903 aa  114  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 656 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  29.07 
 
 		 656 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  25.41 
 
 		 518 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  26.71 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 755 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 518 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 720 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  26.88 
 
 		 673 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  26.97 
 
 		 484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  25.17 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  28.93 
 
 		 581 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 639 aa  112  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 639 aa  112  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 422 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 1034 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 		 656 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.72 
 
 		 519 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  32.27 
 
 		 465 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  32.27 
 
 		 465 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 408 aa  110  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  32.27 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 518 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3849  ATP-binding region ATPase domain protein  28.87 
 
 		 483 aa  110  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  26.03 
 
 		 674 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 581 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  33.77 
 
 		 367 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 671 aa  109  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 515 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.67 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  28.36 
 
 		 581 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 359 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  24.65 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 1519 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 653 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 604 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529725 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  31.82 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  31.82 
 
 		 465 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 		 672 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 378 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 575 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  26.35 
 
 		 661 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 491 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2829  histidine kinase  31.63 
 
 		 602 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 766 aa  108  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 473 aa  108  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.89 
 
 		 491 aa  108  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.96 
 
 		 468 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  27.83 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 480 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  27.83 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.05 
 
 		 744 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>