More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2249 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2249  HflK protein  100 
 
 		 386 aa  775    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3333  HflK protein  44.78 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2356  HflK protein  51.85 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  39.07 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  35.25 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  32.58 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  38.24 
 
 		 394 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  33.43 
 
 		 407 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  34.94 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  32.05 
 
 		 385 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  32.75 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  37.88 
 
 		 393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  37.88 
 
 		 393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  34.43 
 
 		 389 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  33.08 
 
 		 390 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  34.66 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  38.64 
 
 		 394 aa  179  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  36.09 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  31.65 
 
 		 389 aa  179  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  36.61 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  32.08 
 
 		 405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  30.66 
 
 		 357 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  31.28 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  34.88 
 
 		 398 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  36.61 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  32.43 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  33.9 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  36.77 
 
 		 387 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  33.24 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  31.33 
 
 		 414 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  35.4 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  31.57 
 
 		 471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  33.1 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  30.75 
 
 		 400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  30.7 
 
 		 418 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  29.93 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  36.75 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  34.11 
 
 		 386 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  30.33 
 
 		 433 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  30.56 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  31.6 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  32.42 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  26.79 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  30.59 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  29.82 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  30.96 
 
 		 474 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  30.59 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  31.91 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  33.22 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  30.98 
 
 		 393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  32.43 
 
 		 452 aa  156  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  35.89 
 
 		 406 aa  156  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  32.56 
 
 		 451 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  32.56 
 
 		 451 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  32.89 
 
 		 379 aa  155  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  26.77 
 
 		 498 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  32.24 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  30.28 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  32.01 
 
 		 399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  29.8 
 
 		 360 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  28.91 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  33.33 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  32.9 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  33.33 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  29.97 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  33.33 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  31.5 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  31.9 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  33.57 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  32.88 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1787  HflK protein  32.97 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1722  HflK protein  32.36 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  32.43 
 
 		 394 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  31.67 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  29.05 
 
 		 400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  32.73 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  30.26 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  27.47 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  30.26 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  33.33 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  29.48 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  33.63 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02636  integral membrane protease subunit  32.52 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  33.33 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  32.73 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  33.33 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  31.07 
 
 		 389 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  30.63 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  29.14 
 
 		 386 aa  146  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3016  HflK protein  33.46 
 
 		 377 aa  146  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.579125  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  32.46 
 
 		 376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  29.2 
 
 		 395 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  30.67 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  29.19 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0313  hflK protein, putative  32.54 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  30 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  30.03 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  30.03 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  30.03 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  30.03 
 
 		 437 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>