More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2356 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2356  HflK protein  100 
 
 		 374 aa  751    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3333  HflK protein  50.82 
 
 		 374 aa  326  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2249  HflK protein  50.79 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  34.93 
 
 		 383 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  34.29 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  34.77 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  37.67 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  36.12 
 
 		 407 aa  189  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  35.88 
 
 		 389 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  32.87 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  40.21 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  40.21 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  39.79 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  36.86 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  33.6 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  33.59 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  32.39 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  34.19 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  33.78 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  34.91 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  30.79 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  34.77 
 
 		 389 aa  175  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  37.76 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  36.82 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  34.64 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  37.16 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  36.79 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  35.11 
 
 		 433 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  34.64 
 
 		 379 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  34.64 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  34.26 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  28.78 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  29.02 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  32.95 
 
 		 386 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  30.93 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  31.83 
 
 		 394 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  28.85 
 
 		 355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  33.94 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  35.94 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  33.33 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1787  HflK protein  33.11 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1722  HflK protein  33.11 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  31.95 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  35.03 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  33.23 
 
 		 386 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  34.17 
 
 		 436 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  31.44 
 
 		 389 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  34.74 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  33.21 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  29.87 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  30.38 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  33.44 
 
 		 361 aa  159  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3016  HflK protein  33.83 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.579125  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  29.62 
 
 		 452 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  32.39 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  31.55 
 
 		 347 aa  159  1e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  32.72 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  35.69 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  35.69 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02636  integral membrane protease subunit  33.33 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  33.45 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  31.31 
 
 		 360 aa  155  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  33.68 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  36.3 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  31.48 
 
 		 464 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  30.83 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  31.85 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  33.22 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  32.34 
 
 		 378 aa  153  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  32.12 
 
 		 388 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  33.11 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  31 
 
 		 451 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  31 
 
 		 451 aa  152  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  34.08 
 
 		 419 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  34.08 
 
 		 419 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  34.08 
 
 		 419 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  34.08 
 
 		 419 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  33.09 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  29.46 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  34.08 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  34.83 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  34.15 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  29.46 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  29.15 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  30.86 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  30.86 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  34.15 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  32.19 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  30.86 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  30.86 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  30.6 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  34.46 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  34.46 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  34.46 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  34.46 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  34.46 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  34.46 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  34.46 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  29.09 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  33.46 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>