More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3700 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3700  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
402 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3475  glycosyltransferase protein  30.19 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.803016  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  36.48 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.9 
 
 
775 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  38.13 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  32.6 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
409 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  30.73 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  34.57 
 
 
803 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
819 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5888  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 
452 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  33.55 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  33.91 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4095  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
414 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166575  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  31.51 
 
 
404 aa  62.8  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  33.8 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  32.54 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  32.89 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  33.11 
 
 
397 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3078  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0564  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  34.21 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4086  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
380 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  30.99 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4235  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
380 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0474361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
376 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  33.1 
 
 
816 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1790  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
380 aa  59.7  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 
400 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  32.37 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  35.82 
 
 
358 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
446 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  31.03 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4210  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.277795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  28.66 
 
 
387 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  31.72 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  45.59 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 
406 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
820 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
409 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
733 aa  58.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
394 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  34.74 
 
 
382 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
413 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  35.05 
 
 
387 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
367 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.26 
 
 
400 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  34.83 
 
 
392 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4917  group 1 glycosyl transferase  30.43 
 
 
422 aa  57  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  47.37 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
426 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.32 
 
 
388 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
383 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
424 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1916  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
383 aa  56.6  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  29.19 
 
 
396 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  29.63 
 
 
431 aa  56.2  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  32.17 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  31.3 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6405  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
384 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
407 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  29.93 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  39.74 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.69 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
899 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  31.72 
 
 
406 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  36.47 
 
 
396 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  40.62 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
375 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.77 
 
 
351 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
425 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  25.25 
 
 
378 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
827 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
347 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  37.88 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
411 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>