122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3475 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3475  glycosyltransferase protein  100 
 
 		 427 aa  890    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.803016  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3700  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 		 354 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 		 354 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 354 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 354 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.03 
 
 		 354 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 		 354 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 354 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.03 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.03 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.03 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.03 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.03 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.03 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  25.68 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 364 aa  51.2  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0564  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1790  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  26.35 
 
 		 354 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 		 346 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 		 354 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  23.1 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  25 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2065  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 750 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4917  group 1 glycosyl transferase  24.05 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  28.89 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  34.12 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.96 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  35.96 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 373 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.96 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.96 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.96 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.96 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.96 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 376 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0573  putative glycosyl transferase  29.58 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.478763  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0797  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1433  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.03 
 
 		 376 aa  47  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 378 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 354 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.83 
 
 		 354 aa  46.6  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 354 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 354 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 365 aa  46.6  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5888  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355509  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1388  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 354 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  30.63 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  23.19 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1563  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 		 743 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0336  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1881  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.897605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17290  UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase  33.33 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3577  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  22.3 
 
 		 384 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  33.33 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  29.17 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  35.09 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 380 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  25.87 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0868  a-glycosyltransferase  27.94 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0630159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3803  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.551552 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  37.5 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0844  putative glycosyltransferase  27.14 
 
 		 310 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0684167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 359 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1332  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 509 aa  43.9  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.348289  normal  0.202424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  23 
 
 		 354 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0487  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  27.59 
 
 		 360 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>