163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3267 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3267  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0874  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  62.33 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0358  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  57.67 
 
 
325 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0105489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2350  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  52.16 
 
 
325 aa  328  6e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.192031  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2408  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  50.62 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1195  TRAP transporter solute receptor  48.77 
 
 
330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.71869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0194  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  47.74 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022197  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1256  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  45.77 
 
 
344 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1729  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  45.02 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0391409  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3623  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  48.68 
 
 
329 aa  281  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.410742  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1253  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  39.87 
 
 
323 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1229  putative immunogenic protein precursor  32.87 
 
 
310 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3954  periplasmic binding protein, putative  33.33 
 
 
316 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6347  hypothetical protein  30.96 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0846  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  32.87 
 
 
306 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.391191  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2671  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.78 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0468  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.43 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2848  immunogenic protein  31.78 
 
 
328 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.06 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.800081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73120  hypothetical protein  30.74 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1346  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.33 
 
 
316 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.331988  hitchhiker  0.00000684502 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001678  TRAP transporter solute receptor TAXI family precursor  30.85 
 
 
322 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.150837  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00793  hypothetical protein  30.2 
 
 
322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0356  hypothetical protein  29.48 
 
 
324 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.097907  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0746  TRAP-T family transporter periplasmic substrate binding subunit  28.96 
 
 
344 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.842378  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0177  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.31 
 
 
326 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3839  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.5 
 
 
327 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0135422  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0741  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.77 
 
 
348 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2159  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  31.16 
 
 
317 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.13141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4417  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.54 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0674202 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3566  TRAP transporter solute receptor, TAXI family protein  30.31 
 
 
317 aa  126  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.28304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3213  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.74 
 
 
325 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3440  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.47 
 
 
342 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.93321  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003379  immunogenic protein  29.01 
 
 
323 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000812  immunogenic protein  27.44 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0817  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.69 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000102609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4560  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.38 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1413  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  29.69 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0314  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.96 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.889469  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3483  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.69 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06717  hypothetical protein  27.13 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0289  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.26 
 
 
337 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4400  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.31 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478919  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0725  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.97 
 
 
322 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0380  periplasmic-binding protein  29.1 
 
 
342 aa  119  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000526249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02419  hypothetical protein  27.99 
 
 
323 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0608  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.48 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.516133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2949  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.35 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.75 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.745912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3723  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.4 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1635  TAXI family TRAP transporter solute receptor  29.45 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0832335  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1043  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.26 
 
 
327 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4160  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.24 
 
 
312 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2004  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.97 
 
 
338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373091  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0797  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.17 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000423237  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2836  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  33.22 
 
 
346 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1252  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.02 
 
 
323 aa  116  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2594  TRAP transporter solute receptor, TAXI family protein  28.52 
 
 
310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.323017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1635  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.61 
 
 
319 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4226  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.47 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0963703  normal  0.823727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4067  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.84 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.548232  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5002  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.33 
 
 
315 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117483  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1613  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  31.89 
 
 
317 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1472  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.4 
 
 
651 aa  112  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0267  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.89 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418804  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1133  immunogenic protein  29.08 
 
 
351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3828  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.77 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4024  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.77 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1890  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.12 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.966009  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0433  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.77 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3688  hypothetical protein  27.65 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.269569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0937  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.3 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3901  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.77 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0290  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.29 
 
 
317 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0541635  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4101  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.12 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32075  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0664  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.07 
 
 
333 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3568  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.45 
 
 
318 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0457  response regulator receiver protein  29.45 
 
 
318 aa  109  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3381  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.28 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1697  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.97 
 
 
330 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0934  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.15 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2331  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.48 
 
 
322 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699297  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0207  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.8 
 
 
371 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.979925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0461  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.11 
 
 
318 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4446  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.55 
 
 
323 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0645  TRAP-type uncharacterized transport system  28.29 
 
 
335 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0456  immunogenic-related protein  29.56 
 
 
318 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3793  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.1 
 
 
333 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.848653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2072  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.59 
 
 
317 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169091 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2429  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.27 
 
 
329 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25673  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0539  immunogenic protein  25.61 
 
 
313 aa  105  7e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4331  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.94 
 
 
315 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0371  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.84 
 
 
329 aa  105  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.671044  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1194  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.14 
 
 
329 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0386  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.62 
 
 
375 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1156  31 kDa immunogenic protein  29.19 
 
 
316 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1695  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.99 
 
 
315 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0082  immunogenic protein  26.64 
 
 
312 aa  103  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0148349  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2878  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.89 
 
 
335 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.082119  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1556  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.01 
 
 
328 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>