121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1243 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  97.47 
 
 		 237 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  73.66 
 
 		 229 aa  334  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  70.39 
 
 		 240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  52.81 
 
 		 232 aa  224  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  51.98 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  51.98 
 
 		 231 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  50.45 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  45.21 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  44.55 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  44.44 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  45.12 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  46.15 
 
 		 233 aa  168  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  45.83 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  44.39 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  43.44 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  42.29 
 
 		 232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  42.79 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  36.53 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  41.1 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  45.75 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  43.1 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  41.28 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  41.63 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  41.7 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  43.9 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  40.77 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  40.77 
 
 		 252 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  43.41 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  41.7 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  44.29 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  41.82 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  38.27 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  39.91 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  41.67 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  39.38 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  33.04 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0901  ATPase  34.74 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  34.09 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  34.98 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0193  chromosomal DNA replication initiator-related protein  33.33 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0913  hypothetical protein  34.97 
 
 		 218 aa  99  6e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  30.88 
 
 		 211 aa  98.2  9e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  35.35 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  33.19 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2535  DNA replication initiation ATPase-like protein  33.51 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  30.2 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2313  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  28.33 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  30.24 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  30.24 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  28.37 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  27.88 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  29.19 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  27.67 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  28.78 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  28.29 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  28.29 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  30.21 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  29.7 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1643  DNA replication initiation factor  27.31 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  26.64 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2320  chromosomal replication initiator, DnaA  29.07 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2174  Chromosomal replication initiator DnaA  29.19 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  25.85 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  29.02 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1717  hypothetical protein  30.89 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.308602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  30.89 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  27.9 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  25.11 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0896  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  26.27 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2110  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  27.32 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.519557  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2616  DnaA regulatory inactivator Hda  27.22 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.68 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0222  hypothetical protein  28.32 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0660424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02146  Chromosomal replication initiator, DnaA like protein to DnaA protein Hda  26.26 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1343  DNA replication initiation factor  22.89 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000127246  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1576  DNA replication initiation factor  27.56 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.840172  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1651  DNA replication initiation factor  27.56 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0364353  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1643  DNA replication initiation factor  27.56 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135541  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2877  DNA replication initiation factor  27.56 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  24.34 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  24.34 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0673  DnaA regulatory inactivator Hda  28.42 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1916  DNA replication initiation factor  26.79 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3022  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  28.21 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0929  Chromosomal replication initiator DnaA  25.39 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6289100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3317  Chromosomal replication initiator DnaA  24.87 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.159079  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1691  DNA replication initiation factor  27.23 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482582  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0267  DnaA-related protein  27.12 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1926  DnaA-homolog protein Hda  28.57 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1786  DNA replication initiation factor  27.23 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000114863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2499  DNA replication initiation factor  27.23 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1779  DNA replication initiation factor  27.23 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000277265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1823  DNA replication initiation factor  27.23 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000711754  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  26.27 
 
 		 445 aa  45.4  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  26.46 
 
 		 245 aa  45.1  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  23.77 
 
 		 446 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2164  DNA replication initiation factor  27.11 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.2 
 
 		 453 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  25 
 
 		 451 aa  43.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>